FLORA
Debido a la escasez de agua, en Luján de Cuyo la mayor parte de la flora es xerófila (resistente a la sequedad) o halófila (que crecen en suelos salinos). La fisonomía de la vegetación cambia dependiendo de la altitud.
FAUNA
• Animales de Alta Montaña (Cordillera Frontal y Principal): Son especies adaptadas a los fríos extremos y la escasez de oxígeno: aves como el cóndor andino, la agachona de collar, la remolinera castaña, la caminera rande, la bandurria común y el jilguero grande; y mamíferos de montaña como el puma, el zorro colorado, la rata chinchilla y el ratón andino.
• Animales de Montaña (Dominios Andino, Subandino y Patagónico): Al presentar un clima menos extremo y más disponibilidad de refugio y alimento, permite mayor diversidad de especies: choique, inambú silbón, águila mora, aguilucho común, halconcito colorado, búho, palomita dorada, palomita cordillerana, cabecita negra común, comesebo andino, yal plomizo, gaucho serrano, viudita común y chingolo, entre otras aves; y mamíferos como el zorro gris, zorrino, hurón, cuis, rata chinchilla, chinchillón de la sierra, tucu-tucu (o tunduque) y la liebre europea.
• Animales del Piedemonte (entre la zona andina y la Llanura del Este): Buena diversidad de especies, aunque el número de ejemplares es algo escaso dada la fuerte presión del hombre sobre este ambiente. Pueden encontrarse aves como ñandúes, águilas moras, aguiluchos comunes, halconcitos colorados, lechucitas de las vizcacheras, chimangos, caranchos, gallitos arena, coperotes, jotes, martinetas, loicas, fiofíos comunes, calandrias, cotorras y palomas medianas. También pueden encontrarse mamíferos como piches, ratones de campo y maras (liebres patagónicas).
HIDROGRAFÍA
El límite norte del departamento de Luján de Cuyo está determinado por el cauce del río Mendoza. Dicho río nace a partir de la confluencia de tres ríos cordilleranos distintos: el de Las Cuevas, el Tupungato y el de las Vacas. Más de las tres cuartas partes del caudal del Mendoza proviene de los tres ríos mencionados; el resto proviene de riachuelos y arroyos secundarios, también derivados de la cordillera y precordilleras mendocina.
Diques y Embalses
Dique Potrerillos: Es un espejo de agua de grandes dimensiones, creado para regular el caudal del río Mendoza y proveer de energía hidroeléctrica a la región. Además, brinda la posibilidad de realizar deportes acuáticos y contribuirá a la prosperidad de la región, fomentando la actividad turística.
Dique El Carrizal: Es un espejo de agua compartido entre Luján y Rivadavia. Es muy apreciado por la población mendocina, por ser ideal para acampar, pescar y practicar deportes acuáticos.
Dique Cippolletti: Data de la década de 1880, obra del ingeniero César Cippolletti. Gran derivador de agua y pieza fundamental del riego del departamento, contribuyó desde sus inicios al desarrollo económico de Luján de Cuyo. Por medio del Dique Cippolletti, se consigue el aprovechamiento de las aguas del río Mendoza para la irrigación artificial.