FLORA
No departamento de San Rafael estão representados todos os tipos de formações vegetais que caracterizam Mendoza. Assim, podem-se encontrar exemplares de plantas silvestres tais como o solupe, coirón, cortadera, junco, jarilla, algarrobo doce, chañar, retamo, piquillín, zampa e a pichanilla entre muitas outras.
Na zona oriental do departamento predomina a vegetação halófila, a qual coexiste com a formação do algarrobal. No centro da zona se desenvolvem as formações de jarillal e de Huayquerías.
Na parte sul de San Rafael, entretanto, aparece a vegetação que corresponde à formação do coironal e do solupal. Na zona de montanha, a vegetação diminui com a altura, de modo que a partir dos 4.000 metros acima do nível do mar os exemplares sejam muito escassos.
FAUNA
Em San Rafael aparecem espécies animais representativas da de todas as paisagens de Mendoza, como raposas, guanacos, suris e ñandúes, numerosas espécies de roedores e répteis, corujas, chimangos, jotes e outras aves de rapina, quirquinchos, piches e pichiciegos (entre outros tatus), e muitas mais.
HIDROGRAFIA
O departamento de San Rafael está incluído no oásis sul de Mendoza e pôde ser desenvolvido devido ao aproveitamento dos dois rios importantes, o Diamante e o Atuel. O volume médio do primeiro foi calculado em 65 m3/s, enquanto que o volume do segundo está em torno dos 60 m3/s.
Diques e represas de San Rafael:
Os rios Diamante e Atuel puderam ser aproveitados melhor por meio de diques e de represas, os quais favorecem a canalização da água para a irrigação artificial das culturas, consumo humano e para a geração da energia hidrelétrica além das atividades recreativas.
Entre os diques construídos para administrar águas do Diamante, podem ser mencionados o Águas del Toro (represa), Los Reyunos (represa), El Tigre (represa), Galileo Vitali (derivador) e Vidalino (derivador); em quanto aos diques mais destacados do Atuel são El Nihuil (represas), Tierras Blancas (derivador), Aisol (derivador), Valle Grande (represas) e Rincón del Indio (derivador).
De todos eles, são considerados mais importantes as represas Água del Toro e Los Reyunos (no rio Diamante) e El Nihuil e o Valle Grande (no rio Atuel).
