FLORA
Em General San Martín podem ser encontradas espécies vegetais hidrofílicas (associadas ao curso do rio Mendoza), halófilas (nas áreas de deságüe) e halófitas (norte). A vegetação silvestre predominante é característica da província fitogeográfica do Monte: jarilla, junquillos, zampa e juma, entre outras.
Associados ao Rio Mendoza, prosperam a cortadera e o tamarindo; em quanto que nos solos salinos úmidos se desenvolve a pichana.
Há poucos exemplares de alfarrobeira, únicos sobreviventes das florestas exploradas para a obtenção de postes usados para sustentar os vinhedos e levantar alambrados.
FAUNA
Em áreas não cultivadas de San Martín há presença de espécies animais nativas como vizcachas, peludos, pichis, pichiciegos, raposas e lebres. Aparecem também muitos répteis e aves cuyanas carniceiras, como os jotes e caranchos.
Em zonas povoadas existem, por outro lado, várias espécies de aves selvagens habituadas a conviver com o homem, como o joão de barro, pardais, calandra e outras.
HIDROGRAFIA
A única hidrovia permanente que existe no departamento de San Martin é o rio Mendoza, ele de fato, determinar a fronteira com o departamento de Maipú.
Além disso, a exploração das águas do Mendoza e do Tunuyán transformou o departamento em um próspero oásis que hoje em dia é, o futuro imaginado pelo General San Martin quando este ordenou que se traçaram as acéquias através dos antigos Barriales em 1814.