Esta terra foi fundada por Don Juan Amaro del Campo, quem criou a Estância del Totoral, hoje em dia o atual vilarejo cabeceira de nosso Departamento. O avance deste chefe hispânico facilitou anos mais tarde, a implementação das outras propriedades, tais como Saraguilla, Ucumale e Machinte.
Em prol da evangelização, desde o início no século XVII, o Bispo do Chile Fray Pérez de Espinosa, se assentou na área e fundou o Curato de Uco. Posteriormente, os jesuítas chegaram ao Valle los Jesuítas, criando as Quintas Estância de Jesus Maria e de José de Uco.
A alguns quilômetros mais ao sul, chegou o comandante Amigorena, e fundou no ano 1770 o Forte de San Carlos, dando com isso um grande impulso às atividades agrícolas, pecuárias, colocando todas as Quintas e Estâncias sob a jurisdição desse Forte.
Logo em 1786, o Vice-Rei Sobremonte informou a Espanha que o Curato de Uco contava com 412 habitantes e no ano 1778, alcançou o reconhecimento por seu cruzamento para o Chile por Portillo, um fato que favoreceu o crescimento e o progresso do Vale (Curato de Uco), hoje em dia Valle de Uco, que faz parte do nosso Departamento.
Tunuyán pertenceu na sua origem ao Forte San Carlos (hoje o Departamento de San Carlos). Pelo Decreto de 08 de novembro de 1858, a jurisdição de San Carlos e Tupungato, com a cidade cabeceira em San Carlos, foi dividida em dois Departamentos: Tunuyán e Tupungato, com a cidade cabeceira em Villa de la Arboleda.
Em 22 de agosto de 1880, o Governo de Mendoza emitiu um decreto que estabeleceu a jurisdição da Comisaría sur de Tupungato.
Em 25 de novembro do mesmo ano, a Câmara Legislativa sancionou a lei que transformou em Departamento o território antes atribuído à Comisaría, com o nome de Tunuyán, e definitivamente se institui o Departamento em 30 de novembro, 1880, no âmbito do Governo Provincial de Dom Elias Villanueva, quem aceitou uma doação de 9 hectares de terras localizadas no Totoral visando a instalação da atual Cidade de Tunuyán.
Hoje em dia o departamento é a parada final de muitos estrangeiros que se apaixonam pelo bom sol, terra e pelo clima do Vale.
