Cuando los primeros conquistadores españoles arribaron a este valle, encontraron diversos grupos indígenas que vivían en estrecha relación con los cauces aluviales, para facilitar su labor agrícola. Un gran porcentaje de canales de riego, dentro del sistema de irrigación actual, tiene antecedentes pre-hispánicos y Godoy Cruz no escapa a ese contexto.
A juzgar por restos arqueológicos hallados en el Departamento, se puede pensar en rastros de la tribu Tunuyán y no en una presencia huarpeana -como se decía inicialmente- ya que ésta se produce recién a fines del siglo XV, con la dominación incaica de nuestro territorio.
Afirma el historiador mendocino Isidro Maza que al poco tiempo de fundarseMendoza, el Capitán Lope de la Peña se dirigió hacia el sur y a orillas del zanjón Cacique Guaymallén estableció una estancia.
A la muerte del Capitán Lope de la Peña en el año 1.600, su esposa donó la estancia al convento de Santo Domingo Soriano y la propiedad pasó a llamarse «Chacras de Santo Domingo” actual zona de Puente Olive.
Allí los sacerdotes dominicos colonizaron a indios y mestizos enseñándoles los principios de la religión cristiana.
*El Oratorio de San Vicente
En 1.753 en estas tierras se estableció Don Tomás de Coria y Bohorquez, quien en su casa señorial levantó un oratorio en honor del religioso dominico español San Vicente Ferrer. Este oratorio se convirtió en una parroquia alrededor de la cual se estableció un poblado llamado Villa de San Vicente.
En 1.819 los ciudadanos del Barrio de San Vicente pidieron que se construyera una plaza pública en un sitio inmediato a la capilla de San Vicente. Alrededor de esta plaza se establecieron numerosos comercios y residencias de vecinos, destacándose la residencia de la familia Tomba (hoy Banco Nación).
En 1.855 el Gobernador de Mendoza, Don Pedro Pascual Segura, separó el actual departamento de Luján del territorio de San Vicente, diciendo que «en esta última hay una plaza y una capilla, condiciones necesarias que le dan el carácter de villa”.
*Creación del Departamento de Belgrano
En 1.889, la Villa de San Vicente pasó a llamarse Belgrano, como homenaje al creador de la bandera, pero los pobladores siguieron usando el antiguo nombre.
A partir del 1 de enero de 1872 se organiza la Municipalidad del departamento, constituyéndose el primer gobierno comunal encabezado por Don Vicente Maure. En 1895 se constituye el primer Concejo Deliberante cuyo presidente fue Don Rufino Cubillas, acompañándolo en la gestión el Intendente Don Abel Villanueva.
*Fundación de la Ciudad de Godoy Cruz
El 9 de febrero de 1.909 la Legislatura de Mendoza sancionó la Ley N° 472 por la cual se declara ciudad a la que fuera Villa Belgrano, y se fija definitivamente el nombre de Godoy Cruz en honor al Dr. Tomás Godoy Cruz, representante mendocino en el Congreso de Tucumán y además, gobernador de la provincia y notable legislador.
El aniversario del departamento de Godoy Cruz se celebra el día 11 de mayo.